Seinäjoen lentoasema Oy on toiminut Seinäjoen lentoaseman pitäjänä vuodesta 2016. Lentoasema on ollut toiminnassa yli neljäkymmentä vuotta, ja vuosien mittaan tehdyillä merkittävillä investoinneilla on varmistettu, että Etelä-Pohjanmaalla on toimiva kansainvälinen lentoasema, jonka infrastruktuurilla on verrattain pienillä ylläpitokuluilla käyttöikää vielä kymmeniä vuosia. 

Seinäjoen lentoasemaa pitää kotipaikkanaan kaksi lentoyhtiötä sekä aktiivinen ilmailukerho. Lentoasemalla vierailee ympäri vuoden kotimaisia ja kansainvälisiä yksityisiä chartereita ja liikelentoja ambulanssi- sekä elinsiirtolentoja unohtamatta. Vuosittaisia lento-operaatioita kaiken kaikkiaan on noin 4 000, ja jo pelkästään paikallisilla lentoyhtiöillä yksityisiä lento-operaatioita oli Seinäjoella viime vuonna noin neljäsataa. 

Valtio on tukenut Seinäjoen lentoasema Oy:n toimintaa vuodesta 2016 alkaen vuotuisella 150 000 euron ei-taloudellisiin kuluihin tarkoitetulla summalla. Ei-taloudellisella toiminnalla tarkoitetaan viranomaistoimintaan rinnastettavaa toimintaa, kuten esimerkiksi lennonvarmistus-, palo- ja pelastus- sekä turvatarkastustoimintaa. 

Lentoaseman arvoa tai tarpeellisuutta ei voida mitata pelkällä reittiliikenteen määrällä. Lentokenttä on osa valtion infrastruktuuria, ja siihen liittyy vahvasti muun muassa huoltovarmuus-, maanpuolustus- ja terveydenhuoltonäkökulmat. Seinäjoen lentoasemalla on vuosittain useita ambulanssi- sekä elinsiirtolentoja. Elinsiirrot ovat yleensä erittäin aikakriittisiä operaatioita, joissa voi olla ihmishenki riippuvainen siitä, onko lentoasema tunnin vai kymmenen minuutin ajomatkan päässä sairaalalta. Lentoasema toimii myös tärkeänä tankkauspisteenä tarvittaessa erilaisille etsintä- pelastus- ja metsäpalojen sammutuslennoille.