Rengonharju-säätiö on toiminut itsenäisen, Finavian lentoasemaverkoston ulkopuolisen Seinäjoen lentoaseman ylläpitäjänä vuodesta 1977. Säätiö on saanut sekä toiminta- että investointiavustuksia valtiolta ja säätiön taustayhteisökunnilta toiminnan aloituksesta saakka. 

Liikenne- ja viestintäministeri Berner ilmoitti Rengonharju-säätiön edustajille 5.8.2015, ettei valtionavustusta lentoaseman ylläpitämiseen enää myönnetä vuodesta 2016 alkaen. Valtion avustus on ollut merkittävässä osassa säätiön ja siten lentoaseman rahoituksessa. 

Rengonharju-säätiön hallitus on joutunut tämän jälkeen tekemään kipeitä päätöksiä. Rengonharju-säätiön hallitus on päättänyt, että säätiö tulee anomaan Liikenteen turvallisuusvirasto Trafilta Seinäjoen lentoaseman toimilupien päättämistä 31.12.2015. Samalla säätiön hallituksen päätöksellä lentoaseman henkilökunnan palvelussuhteet tulevat päättymään irtisanomisaikoja noudattaen. 

Vuosien saatossa Rengonharjun aluelle on investoitu valtion ja säätiön taustayhteisökuntien yhteistyönä yli 20 miljoonaa euroa lentoasemainfran rakentamiseen, mukaan lukien kiitotie ja lentoasemarakennukset. Lentoasema-alueelle etsitään korvaavaa toimintaa, että investoinneista olisi myös jatkossa hyötyä yhteiskunnalle ja alueelle.