Presidenten håller fast vid makten
I september 2000 föreslogs två nya chefer till Finlands Bank, men ingendera dög åt Halonen. Den föredragande ministern Suvi-Anne Siimes ändrade förslaget i överensstämmelse med presidentens åsikt, och till tjänsten utnämndes Sinikka Salo utanför kandidatlistan. Riksdagens bankfullmäktige, som i princip beslutar om centralbankens direktions sammansättning nöjde sig med lösningen och kom inte med ytterligare förslag.
Den andra utnämningen skedde i november 2001. Bankfullmäktige och statsrådet hade föreslagit Esko Aho och Ilkka Kanerva till nya medlemmar i Finlands Banks direktion. Efter att presidenten återsänt förslaget till statsrådet, gick man med på att föreslå Pentti Hakkarainen, som sedan utnämndes.
Representationen i EU orsakade fortfarande friktion. År 2008 deltog presidenten i EU:s toppmöte om Georgien vid sidan av statsminister Matti Vanhanen. Den nye utrikesministern Alexander Stubb var tvungen att stanna utanför mötesrummet, trots att temat var krisen i Georgien där OSSE fungerat som medlare. Den så kallade tallrikstvisten dök upp i diskussionerna även senare. Statsrådet hade tagit ställning till presidentens deltagande genom att besluta att presidenten kan delta i möten som behandlar ärenden som hör till presidentens behörighet. Om presidenten deltog i Europeiska rådets möten när det fanns en plats för medlemsstatens statsöverhuvud eller regeringschef, hade presidenten, som utnyttjat den plats som utrikesministern hade som statsministerns medarbetare, och utrikesministern stannade utanför mötesrummet. - År 2011 klarlades sedan spelreglerna.